Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms