Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms