Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N6

Sfrp4, Secreted frizzled-related sequence protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp4Q9Z1N6 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms