Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Pfdn5Q9WU28 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Pfdn5Q9WU28 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Pfdn5Q9WU28 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Pfdn5Q9WU28 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Pfdn5Q9WU28 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Pfdn5Q9WU28 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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