Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trpc2Q9R244 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trpc2Q9R244 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trpc2Q9R244 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trpc2Q9R244 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trpc2Q9R244 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trpc2Q9R244 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trpc2Q9R244 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trpc2Q9R244 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trpc2Q9R244 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trpc2Q9R244 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trpc2Q9R244 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trpc2Q9R244 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trpc2Q9R244 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trpc2Q9R244 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trpc2Q9R244 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trpc2Q9R244 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trpc2Q9R244 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trpc2Q9R244 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trpc2Q9R244 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trpc2Q9R244 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trpc2Q9R244 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trpc2Q9R244 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trpc2Q9R244 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trpc2Q9R244 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trpc2Q9R244 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trpc2Q9R244 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Trpc2Q9R244 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trpc2Q9R244 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trpc2Q9R244 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trpc2Q9R244 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trpc2Q9R244 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trpc2Q9R244 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trpc2Q9R244 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trpc2Q9R244 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trpc2Q9R244 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Trpc2Q9R244 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Trpc2Q9R244 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trpc2Q9R244 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trpc2Q9R244 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trpc2Q9R244 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Trpc2Q9R244 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trpc2Q9R244 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trpc2Q9R244 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trpc2Q9R244 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trpc2Q9R244 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trpc2Q9R244 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trpc2Q9R244 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trpc2Q9R244 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trpc2Q9R244 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trpc2Q9R244 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trpc2Q9R244 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Trpc2Q9R244 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trpc2Q9R244 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Trpc2Q9R244 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trpc2Q9R244 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trpc2Q9R244 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trpc2Q9R244 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trpc2Q9R244 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Trpc2Q9R244 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Trpc2Q9R244 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Trpc2Q9R244 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trpc2Q9R244 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trpc2Q9R244 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trpc2Q9R244 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trpc2Q9R244 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trpc2Q9R244 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Trpc2Q9R244 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trpc2Q9R244 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trpc2Q9R244 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trpc2Q9R244 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trpc2Q9R244 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trpc2Q9R244 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trpc2Q9R244 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trpc2Q9R244 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trpc2Q9R244 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trpc2Q9R244 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trpc2Q9R244 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trpc2Q9R244 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trpc2Q9R244 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trpc2Q9R244 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trpc2Q9R244 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trpc2Q9R244 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trpc2Q9R244 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trpc2Q9R244 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trpc2Q9R244 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trpc2Q9R244 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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