Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G7

Zeb2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb2Q9R0G7 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms