Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Wdr54Q9R0D8 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms