Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms