Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME9

Vstm2b, V-set and transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2bQ9JME9 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vstm2bQ9JME9 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 155.8 ms