Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms