Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLM8

Dclk1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk1Q9JLM8 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Gm16305-201ENSMUST00000140747 556 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Psme1-208ENSMUST00000174259 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Gstm2-202ENSMUST00000066530 854 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Prok2-201ENSMUST00000008273 594 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Gm6304-201ENSMUST00000096579 447 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Deup1-201ENSMUST00000045513 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dclk1Q9JLM8 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms