Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Hmgn5Q9JL35 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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