Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Mrpl39Q9JKF7 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Mrpl39Q9JKF7 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Mrpl39Q9JKF7 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Mrpl39Q9JKF7 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Mrpl39Q9JKF7 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
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