Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Mrto4-ps2-201ENSMUST00000164169 549 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Psca-201ENSMUST00000023265 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80 ms