Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gfra4Q9JJT2 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gfra4Q9JJT2 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gfra4Q9JJT2 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gfra4Q9JJT2 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gfra4Q9JJT2 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gfra4Q9JJT2 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gfra4Q9JJT2 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Gfra4Q9JJT2 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Gfra4Q9JJT2 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Gfra4Q9JJT2 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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