Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Slc28a3Q9ERH8 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Slc28a3Q9ERH8 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Slc28a3Q9ERH8 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Slc28a3Q9ERH8 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Slc28a3Q9ERH8 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Slc28a3Q9ERH8 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Slc28a3Q9ERH8 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Slc28a3Q9ERH8 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Slc28a3Q9ERH8 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Slc28a3Q9ERH8 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Slc28a3Q9ERH8 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Slc28a3Q9ERH8 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Slc28a3Q9ERH8 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Slc28a3Q9ERH8 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Slc28a3Q9ERH8 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Slc28a3Q9ERH8 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Slc28a3Q9ERH8 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.15□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms