Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 319.1 ms