Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAT5

Trmu, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrmuQ9DAT5 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TrmuQ9DAT5 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms