Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Atg7Q9D906 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Atg7Q9D906 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Atg7Q9D906 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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Atg7Q9D906 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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Atg7Q9D906 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg7Q9D906 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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