Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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Cnot8Q9D8X5 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cnot8Q9D8X5 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Cnot8Q9D8X5 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Cnot8Q9D8X5 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Cnot8Q9D8X5 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Cnot8Q9D8X5 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Cnot8Q9D8X5 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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