Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Bbs12-202ENSMUST00000108121 2348 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Gm19445-201ENSMUST00000193649 2438 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Gtf3c6Q9D8P7 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Gtf3c6Q9D8P7 Gm7441-201ENSMUST00000220697 1074 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 AC173482.3-201ENSMUST00000225492 1212 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Kif2a-206ENSMUST00000159772 2570 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem260-202ENSMUST00000124720 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 M1ap-201ENSMUST00000113980 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 A730018C14Rik-201ENSMUST00000050754 2253 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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