Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B7

Jam3, Junctional adhesion molecule C, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jam3Q9D8B7 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Gm37785-201ENSMUST00000195783 2408 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms