Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp5Q9D7S9 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.4 ms