Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q1

Ribc2, RIB43A-like with coiled-coils protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc2Q9D4Q1 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
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Ribc2Q9D4Q1 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ribc2Q9D4Q1 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ribc2Q9D4Q1 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ribc2Q9D4Q1 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
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Ribc2Q9D4Q1 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
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Ribc2Q9D4Q1 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ribc2Q9D4Q1 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
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Ribc2Q9D4Q1 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ribc2Q9D4Q1 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ribc2Q9D4Q1 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ribc2Q9D4Q1 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
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Ribc2Q9D4Q1 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ribc2Q9D4Q1 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ribc2Q9D4Q1 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
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Ribc2Q9D4Q1 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ribc2Q9D4Q1 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ribc2Q9D4Q1 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Ribc2Q9D4Q1 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ribc2Q9D4Q1 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Ribc2Q9D4Q1 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ribc2Q9D4Q1 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ribc2Q9D4Q1 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ribc2Q9D4Q1 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Ribc2Q9D4Q1 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Ribc2Q9D4Q1 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ribc2Q9D4Q1 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Ribc2Q9D4Q1 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Ribc2Q9D4Q1 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ribc2Q9D4Q1 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ribc2Q9D4Q1 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Ribc2Q9D4Q1 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ribc2Q9D4Q1 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ribc2Q9D4Q1 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ribc2Q9D4Q1 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ribc2Q9D4Q1 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ribc2Q9D4Q1 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ribc2Q9D4Q1 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ribc2Q9D4Q1 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ribc2Q9D4Q1 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ribc2Q9D4Q1 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ribc2Q9D4Q1 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ribc2Q9D4Q1 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ribc2Q9D4Q1 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ribc2Q9D4Q1 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ribc2Q9D4Q1 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ribc2Q9D4Q1 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Ribc2Q9D4Q1 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms