Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Tubgcp4Q9D4F8 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Tubgcp4Q9D4F8 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Tubgcp4Q9D4F8 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Tubgcp4Q9D4F8 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Tubgcp4Q9D4F8 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Tubgcp4Q9D4F8 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Tubgcp4Q9D4F8 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Tubgcp4Q9D4F8 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Tubgcp4Q9D4F8 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Tubgcp4Q9D4F8 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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