Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

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Length 431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Krt20Q9D312 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Krt20Q9D312 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms