Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9D2Q3 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.6 ms