Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fndc8Q9D2H8 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fndc8Q9D2H8 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Fndc8Q9D2H8 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fndc8Q9D2H8 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fndc8Q9D2H8 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fndc8Q9D2H8 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Fndc8Q9D2H8 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fndc8Q9D2H8 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fndc8Q9D2H8 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fndc8Q9D2H8 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Fndc8Q9D2H8 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fndc8Q9D2H8 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fndc8Q9D2H8 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fndc8Q9D2H8 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fndc8Q9D2H8 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fndc8Q9D2H8 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fndc8Q9D2H8 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fndc8Q9D2H8 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fndc8Q9D2H8 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fndc8Q9D2H8 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fndc8Q9D2H8 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fndc8Q9D2H8 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fndc8Q9D2H8 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Fndc8Q9D2H8 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fndc8Q9D2H8 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fndc8Q9D2H8 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fndc8Q9D2H8 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fndc8Q9D2H8 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Fndc8Q9D2H8 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Fndc8Q9D2H8 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fndc8Q9D2H8 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Fndc8Q9D2H8 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fndc8Q9D2H8 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Fndc8Q9D2H8 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fndc8Q9D2H8 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fndc8Q9D2H8 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fndc8Q9D2H8 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Fndc8Q9D2H8 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fndc8Q9D2H8 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fndc8Q9D2H8 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fndc8Q9D2H8 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fndc8Q9D2H8 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fndc8Q9D2H8 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fndc8Q9D2H8 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fndc8Q9D2H8 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fndc8Q9D2H8 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fndc8Q9D2H8 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fndc8Q9D2H8 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fndc8Q9D2H8 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fndc8Q9D2H8 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fndc8Q9D2H8 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fndc8Q9D2H8 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fndc8Q9D2H8 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Fndc8Q9D2H8 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fndc8Q9D2H8 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fndc8Q9D2H8 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fndc8Q9D2H8 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fndc8Q9D2H8 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fndc8Q9D2H8 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fndc8Q9D2H8 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fndc8Q9D2H8 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Fndc8Q9D2H8 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fndc8Q9D2H8 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fndc8Q9D2H8 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fndc8Q9D2H8 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fndc8Q9D2H8 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fndc8Q9D2H8 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fndc8Q9D2H8 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fndc8Q9D2H8 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fndc8Q9D2H8 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fndc8Q9D2H8 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fndc8Q9D2H8 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fndc8Q9D2H8 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fndc8Q9D2H8 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fndc8Q9D2H8 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fndc8Q9D2H8 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fndc8Q9D2H8 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Fndc8Q9D2H8 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fndc8Q9D2H8 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fndc8Q9D2H8 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fndc8Q9D2H8 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fndc8Q9D2H8 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fndc8Q9D2H8 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fndc8Q9D2H8 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fndc8Q9D2H8 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fndc8Q9D2H8 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fndc8Q9D2H8 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fndc8Q9D2H8 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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