Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pramef12Q9D2F1 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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