Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.2 ms