Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Mrpl28Q9D1B9 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Exo1-201ENSMUST00000039725 7796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Mrpl28Q9D1B9 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Mrpl28Q9D1B9 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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