Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms