Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms