Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0P5

Pygo1, Pygopus homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pygo1Q9D0P5 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pygo1Q9D0P5 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pygo1Q9D0P5 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pygo1Q9D0P5 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Pygo1Q9D0P5 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pygo1Q9D0P5 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pygo1Q9D0P5 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pygo1Q9D0P5 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pygo1Q9D0P5 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pygo1Q9D0P5 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pygo1Q9D0P5 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pygo1Q9D0P5 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pygo1Q9D0P5 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pygo1Q9D0P5 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pygo1Q9D0P5 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pygo1Q9D0P5 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pygo1Q9D0P5 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pygo1Q9D0P5 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pygo1Q9D0P5 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Pygo1Q9D0P5 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pygo1Q9D0P5 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pygo1Q9D0P5 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Pygo1Q9D0P5 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pygo1Q9D0P5 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pygo1Q9D0P5 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pygo1Q9D0P5 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pygo1Q9D0P5 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pygo1Q9D0P5 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pygo1Q9D0P5 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pygo1Q9D0P5 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pygo1Q9D0P5 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pygo1Q9D0P5 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pygo1Q9D0P5 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Pygo1Q9D0P5 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pygo1Q9D0P5 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pygo1Q9D0P5 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pygo1Q9D0P5 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pygo1Q9D0P5 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pygo1Q9D0P5 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pygo1Q9D0P5 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pygo1Q9D0P5 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Pygo1Q9D0P5 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Pygo1Q9D0P5 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Pygo1Q9D0P5 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Pygo1Q9D0P5 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Pygo1Q9D0P5 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Pygo1Q9D0P5 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Pygo1Q9D0P5 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Pygo1Q9D0P5 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Pygo1Q9D0P5 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Pygo1Q9D0P5 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pygo1Q9D0P5 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pygo1Q9D0P5 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pygo1Q9D0P5 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pygo1Q9D0P5 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pygo1Q9D0P5 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pygo1Q9D0P5 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Pygo1Q9D0P5 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pygo1Q9D0P5 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pygo1Q9D0P5 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pygo1Q9D0P5 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pygo1Q9D0P5 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pygo1Q9D0P5 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pygo1Q9D0P5 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pygo1Q9D0P5 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pygo1Q9D0P5 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pygo1Q9D0P5 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pygo1Q9D0P5 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pygo1Q9D0P5 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pygo1Q9D0P5 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pygo1Q9D0P5 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pygo1Q9D0P5 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pygo1Q9D0P5 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pygo1Q9D0P5 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pygo1Q9D0P5 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pygo1Q9D0P5 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Pygo1Q9D0P5 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Pygo1Q9D0P5 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Pygo1Q9D0P5 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pygo1Q9D0P5 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Pygo1Q9D0P5 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pygo1Q9D0P5 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Pygo1Q9D0P5 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pygo1Q9D0P5 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Pygo1Q9D0P5 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Pygo1Q9D0P5 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Pygo1Q9D0P5 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pygo1Q9D0P5 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pygo1Q9D0P5 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pygo1Q9D0P5 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pygo1Q9D0P5 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pygo1Q9D0P5 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pygo1Q9D0P5 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pygo1Q9D0P5 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pygo1Q9D0P5 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pygo1Q9D0P5 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pygo1Q9D0P5 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pygo1Q9D0P5 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pygo1Q9D0P5 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Pygo1Q9D0P5 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms