Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYH6

Rrs1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrs1Q9CYH6 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rrs1Q9CYH6 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms