Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Olfr169-203ENSMUST00000215476 2476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Txk-201ENSMUST00000113604 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Mtfr1-204ENSMUST00000130645 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Gm45354-201ENSMUST00000199820 2557 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Ctcfl-201ENSMUST00000094287 3217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Gm19967-201ENSMUST00000179676 2138 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Sectm1a-201ENSMUST00000026162 1692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Gm37367-201ENSMUST00000191771 2602 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ChtopQ9CY57 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
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