Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mis12Q9CY25 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms