Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms