Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Xrcc3Q9CXE6 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
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Xrcc3Q9CXE6 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
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Xrcc3Q9CXE6 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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