Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms