Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg12Q9CQY1 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms