Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ykt6Q9CQW1 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms