Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms