Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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RTRAFQ9CQE8 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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RTRAFQ9CQE8 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
RTRAFQ9CQE8 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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