Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Use1Q9CQ56 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Use1Q9CQ56 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Use1Q9CQ56 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
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