Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Atg3Q9CPX6 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg3Q9CPX6 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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