Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
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