Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE9

Pbx4, Pre-B-cell leukemia transcription factor 4, mousemouse

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Length 378 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbx4Q99NE9 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pbx4Q99NE9 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pbx4Q99NE9 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pbx4Q99NE9 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pbx4Q99NE9 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pbx4Q99NE9 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pbx4Q99NE9 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pbx4Q99NE9 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pbx4Q99NE9 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pbx4Q99NE9 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Pbx4Q99NE9 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pbx4Q99NE9 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pbx4Q99NE9 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pbx4Q99NE9 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pbx4Q99NE9 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pbx4Q99NE9 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pbx4Q99NE9 AC107763.1-201ENSMUST00000226082 1365 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pbx4Q99NE9 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pbx4Q99NE9 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pbx4Q99NE9 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pbx4Q99NE9 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pbx4Q99NE9 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pbx4Q99NE9 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pbx4Q99NE9 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pbx4Q99NE9 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pbx4Q99NE9 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pbx4Q99NE9 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pbx4Q99NE9 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pbx4Q99NE9 Gm14717-201ENSMUST00000140450 649 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pbx4Q99NE9 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pbx4Q99NE9 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pbx4Q99NE9 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pbx4Q99NE9 Gm29808-201ENSMUST00000194419 468 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pbx4Q99NE9 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
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Pbx4Q99NE9 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pbx4Q99NE9 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pbx4Q99NE9 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pbx4Q99NE9 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pbx4Q99NE9 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pbx4Q99NE9 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pbx4Q99NE9 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pbx4Q99NE9 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pbx4Q99NE9 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pbx4Q99NE9 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pbx4Q99NE9 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pbx4Q99NE9 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pbx4Q99NE9 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pbx4Q99NE9 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pbx4Q99NE9 Ccna1-204ENSMUST00000198320 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pbx4Q99NE9 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pbx4Q99NE9 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pbx4Q99NE9 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pbx4Q99NE9 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pbx4Q99NE9 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pbx4Q99NE9 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pbx4Q99NE9 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pbx4Q99NE9 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pbx4Q99NE9 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pbx4Q99NE9 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pbx4Q99NE9 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pbx4Q99NE9 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pbx4Q99NE9 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pbx4Q99NE9 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Pbx4Q99NE9 Gm25708-201ENSMUST00000177687 102 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pbx4Q99NE9 Gm24370-201ENSMUST00000178007 102 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pbx4Q99NE9 Gm23049-201ENSMUST00000178068 102 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pbx4Q99NE9 Gm28019-201ENSMUST00000178138 101 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pbx4Q99NE9 Gm25571-201ENSMUST00000178322 102 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pbx4Q99NE9 Gm25355-201ENSMUST00000178456 101 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pbx4Q99NE9 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pbx4Q99NE9 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pbx4Q99NE9 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pbx4Q99NE9 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pbx4Q99NE9 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pbx4Q99NE9 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pbx4Q99NE9 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pbx4Q99NE9 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pbx4Q99NE9 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pbx4Q99NE9 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pbx4Q99NE9 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pbx4Q99NE9 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pbx4Q99NE9 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pbx4Q99NE9 Prok2-201ENSMUST00000008273 594 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pbx4Q99NE9 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pbx4Q99NE9 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pbx4Q99NE9 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pbx4Q99NE9 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms