Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gins4Q99LZ3 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms