Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TrabdQ99JY4 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.6 ms